輸入代行業の消費税について

ご記載の文面を拝見すると、ご質問者様の売上は代行手数料だけではないですか？

売上（商品代金、代行手数料、国際送料）

ではなく、商品代金は預り金、代行手数料は売上高、国際送料は顧客負担のようですので預り金、になると思います。
消費税の課税対象は代行手数料のみになります。

ご回答いただきありがとうございます。
金額的には「代行手数料 = 売上　-　仕入れ」となってきますので、商品代金と国際送料を預り金として処理する場合と、結局消費税額は同じになってくると思いますが、いかがでしょうか。
顧客が輸入時に消費税を納税しているというところが引っかかっておりましたが、それは関係なく、結局はサービスは日本で行われている以上、通常の取引同様に利益（代行手数料）部分に課税されると考えればよいのでしょうか。

輸入代行ということですので、貴社が売上と仕入を計上することが理解できません。
「代行手数料＝売上－仕入」とされているのであれば、売上は貴社が輸入したものを国内で販売しますので課税売上、仕入は輸入消費税を貴社が支払いそれを仕入税額控除するという形になるはずですが、輸入時の輸入消費税を顧客が支払っているのであれば貴社が輸入したことにならないと思いますし、消費税は上記の通りですので同じではありません。輸入消費税を貴社と顧客が二重に計上することになるからです。
従いまして、貴社で売上と仕入を立てるのはおかしいと思います。

ご丁寧な回答ありがとうございました。ご教授いただきました通り、商品代金等は預り金として処理をして、代行手数料のみを売り上げとして立てる方法を取ろうを思います。もやもやしていた点がすっきりといたしました。