自宅の家賃を経費にする方法

賃借人を法人に変更して役員社宅とするしかないでしょう。
但し、貴方が法人に賃料相当額を支払わなければいけませんので、全額を経費にすることはできません。
（法人・・家主に支払った家賃が損金、貴方から受取る賃料相当額が益金、貴方個人・・法人に支払う家賃相当額は経費にはなりません。）

今住んでいる賃貸マンションの部屋に法人登記していて、事務所としても使用しているのですが、個人での契約だと経費にすることは難しいでしょうか？

個人契約のまま家主に支払う家賃を経費にすることはできません。
自身の経営する法人でも、法人と役員個人は人格も財布も適用される税制も全く別もの、つまり別人だからです。