義母死亡後の相続・その節税について

パート収入は給与所得、不動産賃貸収入は不動産所得です。
あなたの所得税の扶養内であるためには、これらの年間合計所得額が48万円以内であることです。（これらの収入が年103万円以内ではありません）
したがって、パート収入80万円の場合の給与所得額は25万円（80-55）ですから、不動産所得額（収入-必要経費）は23万円以内であることが必要です。
パート収入、遺産分割協議書作成日及び不動産所得の必要経費を確認のうえ、検討してみてください。

前述の家賃収入、賃貸収入を私の「その他収入」として確定申告するようにするための方法を教えて欲しいです（例：私と妻の間で契約書類が必要など）

については、妻が相続した土地に夫がアパートを建て賃貸するなどならば別ですが、そうでなければ原則、不動産所得は不動産の所有者に帰属しますのであなたの取得にすることはできません。

来年以降、パート収入を65万円程度に抑えれば年間所得48万円以内にできるのではないですか。