住宅ローン控除申請額について

はい、ご認識の通りです。
住宅ローン特別控除の対象となるのは、次の金額のうち、いずれか少ない金額とされていますので、6,200万円となります。
①住宅の取得等に係る借入金の金額（＝3,100万円＋3,400万円＝6,500万円）
②「住宅の取得等に係る対価の額」－「住宅取得等資金贈与額」
　＝7,100万円－900万円＝6,200万円

国税庁サイト「住宅取得等資金の贈与と住宅借入金等特別控除との関係」
https://www.nta.go.jp/law/shitsugi/sozoku/17/08.htm

住宅取得等資金の贈与に係る贈与税の申告は、2020年2月3日（月）から同年3月16日（月）の間に提出する必要があります。

また、住宅取得等資金の贈与税非課税制度の適用要件として、以下がありますので、ご注意ください。
（ご質問の文章から察するに、2020年1月に引渡しと思いますので大丈夫だと思いますが、気になりましたので、念のため記載いたします。）
・贈与を受けた年の翌年3月15日までに住宅取得等資金の全額を充てて住宅用の家屋の新築等をすること。
・贈与を受けた年の翌年3月15日までにその家屋に居住すること又は同日後遅滞なくその家屋に居住することが確実であると見込まれること。
(注) 贈与を受けた年の翌年12月31日までにその家屋に居住していないときは、この特例の適用を受けることはできませんので、修正申告が必要となります。

詳細は以下国税庁サイトをご覧ください。
「No.4508 直系尊属から住宅取得等資金の贈与を受けた場合の非課税」
https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/taxanswer/sozoku/4508.htm