年末調整と確定申告

　　回答します。

　　年末調整の控除時に申請（控除）しても確定申告時に控除時ににあたらめて申請しても、貴方のやりやすい方で控除を受けることができます。
　　特にどちらでされても大きくは変わらないと思います。

　　ただし、会社の方が特に問題にしないのであれば「年末調整」時に申請された方が、会社で一旦チェックしてくれますし、源泉徴収票にも記載がされますので、手間としては少なくなる可能性があります。
　　貴方の都合の良い方法をお選びください。

先生

こちらもご回答いただきありがとうございます。

追加で質問です。
国民健康保険、国民年金、国民年金基金、どれも1年分を一括で払っており、10月から社保に入ったことにより還付金がある予定です。
しかし、国民年金基金の控除証明書は一括で支払った金額が記載されています。
こちらはそのままの額を控除しても大丈夫なものでしょうか？
まだ還付金がいくらかは不明です。

よろしくお願いいたします。

　　回答します

　　還付される金額がある場合、支払った金額全額（1年分）の控除は難しいと思います。そのような事情でしたら、還付金額が分かるまで待った方が良いと思いますので、確定申告の際に控除することをお勧めいたします。
　　なお、確定申告時までに不明な場合は、各担当事務局に金額を確認されたうえで申告するか、見積もったうえで申告されれば確実だと思います。

お忙しい中わかりやすい回答をいただきありがとうございます！
感謝いたします。

ベストアンサーをありがとうございます。
　少しでもお役に立てましたら幸甚です。