共有物件での一部の所有者が売却した時のe-Taxの記載の仕方

貴殿のケースでは、２／３所有権を各１／２ずつ売却ですから、共有者２名で入力しつつ、売却した持分は１／２入力。
その他の記載欄などで、「２／３を売却した」と記載すると内容がわかると思います。どちらにせよ税務署は２／３売却だと登記情報でわかります。
結果的に計算が合えば問題ないと思います。

丁寧なご回答をいただきありがとうございます。
先生がお教えくださったように、共有者２名、売却した持分は１／２ずつで入力し、金額のつじつまが合うように致します。また、特記事項として「不動産は全部で２／３を売却した」と記載いたします。

坪井先生
今回の母と私の１／３ずつの売却の場合、不動産の代金（譲渡価格）は同じなのですが、売却するための要した費用が異なるため、譲渡所得が二人で異ってきます。
この場合、結果的に計算を合わせるために、母と私のそれぞれが、共有物件ではない形で記入し、特記事項に「売却した不動産は、実際は３名の共有であり、このうち２名分（２／３)を売却し、私所有の１／３に関して記入し申告した」と記載することで如何なものでしょうか？

ＯＫです。
例えば、売却時に１人だけ住所変更費用がかかったりするケースなど、費用が個人ごとに違うケースはあります。
正確に計算されようとしているだけのことですから、なお良いと考えられます。
売却した１／３だけを表記した書き方で、問題になることはないです。

坪井先生
早々の回答ありがとうございます。
税務署が共有物件の一部売却だと登記情報でわかることから、税務上正確にするためならば、共有物件ではない形で記入し、確定申告することで問題ないことで理解いたしました。
本当に助かりました。