短期アルバイト２社以上の掛け持ちの際の年末調整　確定申告の注意点、方法を教えてください。

回答します

　メインのアルバイト先には「扶養控除申告書」を提出していると思いますので、毎月の源泉所得税額及び年末調整による源泉所得税は発生しないと思います。

　短期のバイトは、日雇いでない限り「乙欄課税」として源泉所得税額が発生していると思います。
　※「扶養控除申告書」を提出している方は「甲羅課税」として、88000未満は税額が算出されませんが、「扶養控除申告書」は一か所にしか提出できません。

　2か所以上から給与収入を得ている時には「個人で年末調整」というよりも、所得税確定申告により年間の所得金額と税額を計算し、清算する必要があります。
　そのため、まずは全部の会社の「源泉徴収票」を発行して貰ったうえで年明けに確定申告をすることになります。
　その他必要なものは
　①　身分証明書
　②　マイナンバーの分かるもの（マイナンバーカードの場合は「①」は不要）
　③　学生証
　　　※　給与収入が103万円を超えた場合であっても勤労学生控除を受けることで税額が少なくなります。
　④　ご自分が支払った「国民年金」の領収書（親御様が支払った場合は親御様の社会保険料控除になります）
　⑤　ご自身の銀行口座（還付になる場合）
　などになります

　確定申告書は、国税等P\HPの「確定申告書作成コーナー」で作成しますと簡単に作成できます。今年の分（来年申告）は年明けに更新されますので、それまでお待ちください。

　注意事項として、貴方は親御様の扶養に入っていることと推察します。給与の収入金額が103万円を超えると扶養から外れますのでご注意ください。

個人で年末調整はたんなる記入ミスでした。わかりにくくてすみません。

結論はメインのバイト先であるA社含めて確定申告を行うという認識で大丈夫でしょうか。

ご理解のとおりとなります。

　なお、合計所得金額が48万円以下（給与所得の時は収入金額103万円以下）の場合確定申告義務はありませんが、還付となる場合は申告することができます。
　
　また、仮に年税額が算出されなくとも年末調整をする「A社」には「勤労学生控除」の申請はするようにしてください。