親名義の不動産の一部を買取るのは税務上問題があるか

　時価－買取価額が１１０万以上になると、「低額譲受」として贈与税が課税されます。（相続税法第７条）時価はおおむね路線価×面積÷０．８で計算すれば良いと思います。
　ローンの肩替わりをして不動産の名義変更をした場合は、譲渡者（義理の親御さん）にローン残高であなたに売却したことになるので、所得税（譲渡所得・・（譲渡価額－取得費－譲渡費用）×１５％　（所得税）及び５％（地方税））が課税されます。

池田先生
ご回答ありがとうございます。
私が無知で恐縮ですが、そうすると仮に適正な時価を算定したとして持ち分の10分1程度を買い取った場合は贈与の問題は生じずに、義理父側も通常の売買の様に2,000万円の所得を得た事による所得税という理解でしょうか？

　2,000万円×０．８÷路線価で得た面積を分筆するか、2,000万円／（路線価×面積÷０．８）の持分を移転登記すれば低額譲受けとはならないと思います。
　義理の親御さんの譲渡所得については、2,000万円－取得価額－譲渡費用で計算され、税率は譲渡の年の1月1日現在で所有期間が5年を超える場合は、所得税１５％、地方税５％です。（所有期間5年以下に場合はそれぞれ２倍の税率となります。）

池田先生
お忙しい中ご回答頂きありがとう御座います、義理父と話をしてみたいと思います。

お世話になります、追加で1点教えて下さい。
義父には概ね了解を得られたのですが、
この場合、義父は居住用財産の3000万円の特例を使えば所得税を0に
出来ますでしょうか？

　売主と買主との親族関係が直系（親子・祖父母と孫）・配偶者でなければ適用可能です。しかし、持分の一部譲渡の場合（譲渡者の持分の全部譲渡は除く）は適用除外となります。