直系尊属から住宅取得等資金の贈与を受けた場合の非課税について

文面から分かる範囲でお答えいたします。

この場合、非課税限度額は1000万円に暦年贈与の非課税分110万円を合わせた1110万円が非課税の対象となり、残りの490万円が課税の対象となります。

係る分は税金を支払う、借入にする(きちんと返すことが必要です)、名義を入れる、相続時精算課税にして納税を相続時に先延ばしにする方法が一般的です。

毎年110万円ずつもらう方法もなくはないですが、予め毎年110万円を5年にかかって贈与する約束をした場合は、550万円を約束した年に贈与した事になり、贈与税がかかりますので注意が必要です。

贈与を受けた年の翌年3月15日までに住宅取得等資金の全額を充てて住宅用の家屋の新築等をすること


正しくは、贈与を受けた年の翌年の3月15日までに引き渡しを受け、できればその日まで、遅くとも贈与を受けた翌年の12月31日までに入居する必要があります。
なお、住宅取得等資金の贈与の非課税制度のもとでもらったお金は全部物件本体の代金にあてる必要があり、支払い前に受け取る必要があります。
もらったお金で支払ってください。

ご参考になれば幸いです。

ご回答ありがとうございます。
借入にする(きちんと返すことが必要です)、

上記について具体的にどのような手続きが必要でしょうか。
よろしくお願いいたします。

＞上記について具体的にどのような手続きが必要でしょうか。

手続きというよりも借入や返済の方法となりますが、

返済期限も勘案して父親から借りる。
借用書を作る(印紙もきちんと貼る)、
毎月利息(既存の住宅ローン並の利息が望ましい)もつけて返す。
返済は記録に残るように銀行振込で返す。
返済は他のローンと合わせて無理のない金額とする。
なるべく相手が80歳になるまで返す。

といったことが必要です。
借入自体に税務署への申告は必要ありませんが、資料や返した痕跡は残しておいたほうがいいです。

ご参考になれば幸いです。