期末棚卸資産の決算申告について

入力の仕方はよく分からないのですが、1期目の棚卸計上額は、2期目の期首棚卸計上額になっていますか？
期末棚卸の額は2期目で棚卸をした額だけでよく、1期目の棚卸額を反映させなくていいとおもわれます。(評価方法により前期の棚卸額を使う方法もあることはありますが...)

1期目の棚卸計上額は、2期目の期首棚卸計上額になっております。

今期は仕入等はしておらず、前期の売れ残りのみを売った結果、まだ在庫が出た事を申告するつもりで入力は2期目の棚卸額を入力したのですが、前期の資産が継続されているようです。
ちなみに損益計算書では今期の棚卸額のみ記載されております。

貸借対照表には、前期残高の欄に1期目の期末棚卸額、借方金額の欄に2期目の期末棚卸額、期末残高の欄に合計が記載されています。

説明が乱雑で申し訳ございません。

入力の仕方はわかりませんが、仮に前期の棚卸商品が5万円分売れたとしたら次のようになってないといけません。
期首商品棚卸高 100,000円
当期仕入高 0円
期末商品棚卸高 50,000円
そのソフト自体を使ったことがないため私も説明もうまくできない状況ですが、期末に残っている商品の額がそこに入るはずです。

お忙しい中、ご回答いただき有難うございました。