確定申告　初めて！

資本金100万円で会社設立したなら、減資等しなければ、資本金1万円になりません。差額は役員貸付金として処理するしかないと思われます。その場合、会社として貸付けているわけですから、会社は利息をもらってください。

会社登記の際に、100万円を入金した口座は貴方名義の「個人口座」だと推察いたします。貴方の口座に入金されていたとしても、その金額は「会社のお金」になります。
　
　本来、法人口座を開設した時にその金額を異動させるべきでしたが、個人の口座に入金したまま又は使ってしまった場合は、個人が会社からその金額を借りたことになりますので、会社に返済するようにしてください。

回答ありがとうございました。
会社に返済するようにして下さい。とは、
実際どういう事をし、どう仕訳をきればいいのですか？

回答します

　設立時の会社の「貸借対照表」は、
　　現金　100万円　/資本金　100万円　となります。
　
　個人の口座にそのままの状態になっいたのであれば、そのままの状態でも良いのかも知れませんが、個人のお金と混在してしまっている場合は、次のような仕訳をすることになります。
　　貸付金　100万円/　現金100万円　という仕訳をします。

　会社としては「貸付金（資産）」、個人としては「借入金」になりますので返済期限を決めて、会社の口座などの貴方が入金した時点で（仕訳）をしていくことになります。
　返済（入金）時の仕訳は
　　普通預金　/　貸付金　　となります。

　もともと、資本金として入金したお金は、既に個人のお金ではありませんので、そのお金を使わずそのまま残っているのでしたら、なるべく早いうちに、法人の口座に入金されることをお勧めします。

米森先生、丁寧な回答ありがとうございました。
今回の決算では、
現金/資本金、と仕訳をし、
出来るだけ早く、法人口座に資本金を入金する様にします。
御教授ありがとうございました。

すこしでもお役に立てましたら幸甚です。
　これから本格的に法人の活動が再開されるようですが、色々と大変なことがあるかもしれませんが頑張ってください。