非居住者が源泉徴収されると経費が使えなくなるという事ですか？

非居住者が日本で源泉徴収されると日本での経費控除はできなくなりますが、マレーシアでの確定申告時に経費を控除できる可能性があります。また、二重課税を避けるための措置が両国間で講じられています。
非居住者となった場合、日本からの原稿料は国内源泉所得として扱われ、源泉徴収の対象となります。日本とマレーシアの租税条約に基づけば、原稿料はロイヤルティーとして扱われ、租税条約届出提出により源泉徴収税率は10%となります。この源泉徴収で日本での課税関係は終了し、日本では経費控除の機会はありません。

マレーシアでは、2022年1月1日以降、居住者が国外で得た所得（原稿料を含む）をマレーシア国内で受領した場合、原則として課税対象となります。マレーシアの税制では、所得を得るために必要な経費は控除可能です。したがって、原稿執筆に関連する経費（例：参考資料の購入費、通信費、事務用品費など）は、マレーシアでの確定申告時に控除できる可能性が高いです。

日本で支払った源泉徴収税は、マレーシアでの確定申告時に外国税額控除として申請することができます。これにより、同じ所得に対して二重に課税されることを防ぐことができます。

ご丁寧な回答ありがとうございます。とても困っていたので参考になりました。