交通費の立替分の消費税について

請求書の現物を見ないと回答できないご質問ですが、通常、司法書士が発行する請求書には課税対応の明細が明記されていると思いますので、ご確認ください。

課税対応の明細には対象外とされていて（印紙税とかの欄に入っている）実費精算の金額ではないと思います。（あまりにも区切りが良すぎるので）なぜ課税の対象外になっているのでしょうか。

それは請求書を発行した司法書士にお聞きいただかなければわかりないことです。