株式会社の解散後について

税務署に解散の届（異動届出書）は提出されましたか？
法務局から自動的に連絡がいく訳ではありませんので、届出がなければ税務署は解散の事実を知りませんから、申告時期が来たので書類が送られてきたのだと思います。
なお、会社は解散だけでは消滅せず、最終的に清算登記をして消滅します。
また、解散の日から清算決了までの期間は解散事業年度の決算申告が、清算決了後は清算申告をしなければなりません。
ご自身で解散登記申請をされたということですが、解散から清算までは、税務署だけではなく都道府県や市町村などの関係官公署への様々な手続きが必要ですので、失礼ながら漏れている可能性があります。
直接、司法書士や税理士に相談されたほうがよろしいかと思います。