確定申告、交通費について

入金額をそのまま経費にはできないです。前払勘定にしておき、その都度交通費に振替えます。

ICカードへの入金額をそのまま経費計上することは原則認められません。
旅費交通費として経費にできるのは、実際に業務に使用した金額部分のみです。したがって、「〇〇駅〜〇〇駅」「訪問先」など、業務目的が明確な区間を記録し、その合計額を経費とするのが適正な処理です。
なお、同一経路を頻繁に利用する場合には、定期区間や業務ルートをまとめた一覧表を作成しておくと、証憑として十分に認められるケースもあります。ICカードの入金履歴や利用明細を保管し、私用分と業務分を区別しておくことが重要です。