住宅取得の非課税制度贈与金（頭金）とオーバーローンにおけるお金の流れ

お世話になります。

ご質問に対する回答）
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贈与者から直接に質問者さまの口座、質問者さまの口座から直接に売主へ支払う・・・という流れ一択だと個人的には整理しています。

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補足）

住宅取得等資金の贈与に係る贈与税の特例は、住宅用家屋の新築、取得の対価に充てるための金銭の贈与を対象とする特例であり、贈与を受けた金銭の全額を新築等の対価に充てることが要件となっています。

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参考）

贈与された金銭を住宅ローンの返済に充てる場合、取得対価の支払いに間接的に充てているという考え方もあるものの、法の予定する住宅用家屋の取得の対価に直接充てることには該当せず、従来から本特例の適用はないものと実務上は解されています。
（国内最大級の税理士集団の全国会QAでも同旨の事例が示されています）

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住宅ローンにつき金融機関から売主へ直接支払される場合は、住宅取得資金贈与分を対価に充てたとは整理できないと考えます。

他方、いったん住宅ローンにつき金融機関から質問者さまに入金される場合は、贈与を受けた金銭の全額を新築等の対価に充てたことによるローンの使途残金については、金融機関の指示により強制的に内入れとなるものと考えられ、住宅取得資金贈与分を対価に充てたものと整理できる余地があるとは個人的には考えます。

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他の方のアドバイスも参考になさってください。少しでもご参考になりましたら幸いです。

重要なのは、どの口座を経由するかだけでなく、贈与金が対象となる住宅取得等の対価へ実際に充てられたと説明できることです。贈与金と融資で同じ代金を二重に賄い、贈与金相当額が手元に残る計画なら、非課税の適用には慎重な確認が必要と考えられます。売買代金・対象工事・諸費用を区分した資金表を作り、自己資金、贈与金、融資の支払先・金額を銀行と調整してください。振込記録、精算書、契約書を残し、決済前に税理士へ対象額と期限・申告書類をご確認ください。

※本回答は一般的な情報提供を目的としたものです。詳細な判断は管轄の税務署への確認や、税理士への個別相談をお願いいたします。