個人事業主→役員　年末調整、確定申告

役員報酬を含む給与所得は年末調整をするのが原則ですから4～12月の役員報酬（給与所得）を年末調整し、年末調整後の給与所得と1～3月の事業所得を合算して確定申告をします。

以下の様になります。
4月〜12月分　会社で年末調整をし、過不足を支払う、還付する。
1月〜3月分の事業所得と給与所得を合わせて確定申告をする。

お二方、ありがとうございます。

源泉徴収税、所得税は還付される前提でお話しすると、

会社で年末調整をし、源泉徴収税が還付され
確定申告でも所得税が還付される

ということはあり得る話でしょうか？

また、生命保険等の控除は
年末調整で提出するのがいいのか、
確定申告で申告するのが良いのか、
どちらがよろしいでしょうか？

お願いいたします。

事業所得が赤字であれば確定申告で還付される可能性はありますが、黒字であればありません。
生命保険等の控除は年末調整で行っても、確定申告では年末調整で生命保険控除等はなかったものとして再度計算しますので、どちらでも結果は同じです。
令和4年分のものですが、確定申告の手引きに則って実際に確定申告書を作成されれば必然的に理解できます。
https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/shinkoku/tebiki/2022/pdf/001.pdf