譲渡所得による確定申告

遺産分割協議書の書き方がおかしい気がします。

そもそも、
買取価格から販売にかかる諸経費を引いた売却益

という表現がおかしいです。
販売にかかる諸経費とは、普通は仲介手数料程度だと思う。3％強ぐらいかと思うが、例えば売却するには境界確定が必要とか、汚染物質があるため処理に多額にかかるなどの事由が存在するのでしょうか？
売却益は、売却価格から取得費及び譲渡費用を差し引いた金額なので、売却額から諸経費を引いても売却益とは言いません。
（取得費は亡くなった人の取得費を引き継ぎます。5％の選択もありですが、この金額は既に支出されているため、売却時に支出するものではありません。）

もし、2人が売却にかかる税金を負担する約束なら、登記を片方にするのは間違いです。登記情報は税務署が把握できますので、登記を片方、税務申告は2人だと、問い合わせがあるでしょう。
その際、不適切な遺産分割協議書ではトラブルの元です。

専門家に見てもらって、税金の負担を含め、誤解の生じない文言の遺産分割協議書を作成すべきかと思います。