食品ロスの計算

回答します。
特に計算は不要です。理由はすでに仕入計上されているからです。
その仕入に対する売上がないので、自動的に仕入分に対する売上「0」となり仕入分が損失になります。
さらに合わせ、処理費用も加わりますので、それらの合計が食品ロスに対するものと判断してください。

税務調査で食品ロスの説明する時はどうしたらいいのでしょうか？

回答いただきありがとうございます

税務調査では廃棄した事実、すなわち廃棄した処理費用などで説明可能です。