住宅取得資金等贈与非課税の適用について

すでに支払った手付金300万は立替払いであとから援助してもらったこととし、

自身が先に支払った分をあとから援助してもらうのは、住宅取得資金贈与の特例の対象とはなりません。

さらに頭金を200万（仮に手元に200万残す場合）追加で支払えば、

200万円を住宅の取得資金に直接充てるのであれば住宅取得資金贈与の特例の対象となります。

400万の援助を全額充てたこととみなされるのでしょうか。

なりません。上記の通り、200万円は住宅取得資金贈与の対象となりますが、200万円は暦年贈与となり200万円－基礎控除110万円＝90万円が贈与税（90万円×10％＝9万円）の対象になります。

ご回答ありがとうございます。
①手付金を頭金に当てずに返金してもらい（ということができるのかわかりませんが）改めて400万を頭金として支払う
②頭金を290万を追加で支払い、残りの110万は非課税分として手元に残せる
上記のいずれかの選択肢が考えられるという理解でよろしいでしょうか。
いずれにしても銀行と不動産屋にも相談してみようと思います。

そのようなご理解でよろしいかと思います。
但し➁の場合はローンの金額を290万円減らす必要があると思います。
300万円＋290万円＋住宅ローン＝購入価額になるはずだからです。

迅速かつご丁寧な回答ありがとうございました。