年末調整と所得税の関係について

お答えします。
給料を支払った時の、源泉徴収での所得税の天引きは、仕訳でいいますと
借方　給料　/　貸方　預り金
となります。
翌月１０日に預かった所得税を納税する時の仕訳は、
借方　預り金　/　貸方　現金
となります。
小規模の事業所では、納期の特例といい、半年ごとにこの預り金、所得税を納付する制度を適用しています。
この半年ごとの特例の場合には、会社が立て替えるということは通常出てきません。
例えば、源泉所得税を毎月ごとに納税している場合で、年末調整をして、還付が出たとします。
１２月の給与などで新たに発生した源泉所得税の金額より多く、還付金が発生してしまうと、全部還付しても、まだ、還付しきれない額が残ることになります。
その場合に、会社の方では、一旦、還付金を立替えて、還付してあげて、翌月である、翌年１月移行に源泉徴収した預り金を納税する際に、立替えた分を返してもらって、税務署に納付する額から差し引くことをします。これが１月だけで終わる場合もあるし、２月までかかる場合もあると思います。
これは、一般には行われる形の一つではあります。
まれに、立替分を戻してもらうのに２ヶ月以上かかる場合には、税務署に、残存過納額明細書という還付請求書を提出すれば、税務署からまとめて還付してもらうこともできます。
おわかりいただけましたでしょうか？
以上回答とさせていただきます。