仕入れにかかった手数料の仕訳方法

(2)ですね。
　仕入れ勘定は、混合勘定といって、「経費と資産が混合されたもの」になります。市場という特性上、期末(年末)の在庫はあまりないと思いますが、一般に仕入れたものの期末在庫は資産に数えなおさなくてはなりません。これを棚卸という手続きになります。
　一方で、市場の手数料は、売れる売れないにかかわらず、仕入に伴ってかかる手数料になります。これを原価計上するかによりますが、手数料に定額部分があったり、仕入数量によって割引があったりするのであれば、原価ではなく一般的な販売経費とみることもできます。
　逆に、仕入れ値の10％などと決まっているようであれば、「購入のために必要な費用」として（勘定科目にかかわらず）棚卸に挙げるべきでしょう。
　質問者様が、粗利益（売上ー原価）をみることが大切とは思いますが、どの切り口で見るかが重要であり、仕入手数料を込みで見るのであれば、原価に、見ないのであれば販売経費（必要経費）に入れるべきと思います。
　なお、支払先が市場の仲卸組合であれば、（１）でも特に支払先として間違っていないので、無用なトラブル（支払先との金額が異なるなど）が無いと思います。

ご回答いただきありがとうございます。
大変勉強になります。
仕訳に慣れた頃なのですが、まだまだ分からない事ばかりで、奥が深いです。
ご回答して下さった通り、（2）で仕訳をします。
どうもありがとうございました。