監査役協会への入会金・年会費

入会金や年会費は、資産の譲渡等に係る対価に該当しないため、不課税となるものと思います。
年会費も入会金も、「諸会費」などの科目で処理されているケースが多いように思います。

ご回答ありがとうございます。どうも弊社では「諸会費」を使用したことがないようで・・・。これは「支払手数料」の科目でも可能だったりしますでしょうか？

科目は、「会社内部での分かりやすさ」と「外部への説明のしやすさ」を考慮して決定するのが基本的な考え方だと思います。
すなわち、内部的な理解として、
・入会金とは「会員となるための初期登録手数料」
・年会費とは「会員としての地位を維持するための手数料」
だと考えるのであれば、「支払手数料」としても宜しいかも知れません。
一方で、貴社の決算を目にする外部者（株主や税務署、金融機関など）からすると少々違和感が残る事になるかも知れないので、そこは丁寧に説明をする必要があるように思います。