妻の共有持ち分を買取ってローン返済に充てたい

「妻の持分が減らないようになるべく高く買い取りたい」は、妻が損しないようにという趣旨でしょうか？
妻の共有持分を買い取るということは、妻の共有持分が減り、夫の共有持分がその分増えることなので、妻の持分は減ります。

ところで、低額譲渡又は高額譲渡の場合、本来あるべき価額（時価、第三者間で成立すると思われる価額）との差額は、妻又は夫からの贈与とされます。譲渡所得がかかるかどうかは関係ありません。

もっとも、贈与税の基礎控除は年間110万円ありますし、そもそも時価は、概念的には分かっても、絶対この金額とはいえるものではありません。
なお、相続税評価額は、売買のような対価を伴う取引には使えません。一般に、相続税評価額は、時価の８割程度とされており、場合によっては0.8で割った金額が使えるかもしれませんが、実際のところはケースバスケースです。

以上の通り、「譲渡所得がかからない範囲であれば、価格を高めに設定しても問題ない」とはいえません。

譲渡所得が出るかどうかは、過去の取得費と実際の売買金額との差額であり、低額譲渡かどうかは、現在の時価と実際の売買金額の差額です。

長谷川様、早速のご回答ありがとうございます。
「妻の持分が減らないようになるべく高く買い取りたい」の部分ですが、わかりにくい表現で申し訳ありませんでした。
わたしが妻の持分をより高い価格で購入すれば、妻の持分の一部しか購入できません。
そうすれば、妻には残りの持分が残るので、妻の財産が減らないという意味でした。

購入価格が時価より低ければ、妻から私への贈与、時価より高ければ私から妻への贈与ということになるのですね。
時価より高くても贈与になるということがわかって助かりました。
おっしゃるとおり、時価を割り出すのが非常に難しく、質問した次第です。
費用はかかりますが、不動産鑑定士にお願いした方が無難なようです。