別世帯の妹への給与について

既にご承知かと思いますが、従業員に対して給与を支払った場合には、給与から所得税を源泉徴収する手続が必要になります。
このような源泉徴収義務者には、税務署長等に対して、次の届出が必要です。
①「給与支払い事務所等の開設届出書」（開設時）
②「源泉所得税の納期の特例の承認に関する申請書」（開設時）
③「給与所得の所得税の徴収高計算書」（いわゆる納付書による納付）
　7月10日までと1月20日まで
④「給与の支払状況内訳書」1月末まで
⑤「給与所得の源泉徴収票等の法定調書合計表」1月末まで
⑥「給与所得の源泉徴収票」1月末まで（市町村へ）
あとは、⑦「源泉徴収簿」の作成です。
ご質問者は、既に一人従業員を雇っているということですので、①、②の届出は済んでいると思いますので、そのほかに特段の手続は必要ありません。
③、④、⑤について、従業員と妹さんについて合計した金額などを記載して提出していただくことになります。
妹さんは、親族ですが、別世帯の者（生計を一にしません）ですから、青色事業専従者（あるいは白色事業専従者）には該当しませんので、普通の従業員と同じ扱いになります。
次に、確定申告の留意点については、「青色決算申告書（又は「収支内訳書」）の「給与賃金の内訳」欄に、従業員のほかに妹さんへの給与支給額等を記載することくらいです。
特に、一般の従業員と同じように考えて処理していただければよいでしょう。

ありがとうございます！
無事手続き完了しました。
大変助かりました。