相続時の建物買い取りにかかる税金、低廉譲渡に関する質問です。

　相談内容から推測すると、遺産分割協議は整っていないので、実質的にご兄弟４人で各人４分の１ずつの共有状態となっています。これを四男の方の不動産会社に名義変更するには、４人全員に「ご長男の持分4分の１　あなたの持分４分の３」で相続する旨の遺産分割協議書に署名・押印してもらうことが必要です。そのうえであなたの持分４分の３の３分の１（全体の４分の１）を四男の方の会社に1250万円で譲渡すれば良いと思います。このときあなたには1250万円を収入金額とした譲渡所得が課税されます。
　ご質問の方法ではやはり低額譲渡になりますが、譲渡先が会社（法人）ですので、低額譲受けによる贈与税の課税ではなく、相続人全員が時価（5,000万円）の１／２（2,500万円）以下で譲渡すると、４人全員に各人1,250万円を収入金額（譲渡価額）として譲渡所得が課税されます。

回答ありがとうございます。
後半の部分が私の脳みそでは、理解するのが中々難しいです…
お手数で申し訳ないですが、具体的な金額でご教授お願い出来ませんか？

　全体の土地・建物の時価は5,000万円で、弟さん２名はあなたが相続することに異議はないとのことなので、遺産分割協議により、お兄さんの相続分の４分の１をお兄さん名義、残りの4分の３をあなたとして共有名義で相続登記します。この結果、あなたの所有権の価額は3,750万円、お兄さんの所有権の価額は1,250万円となります。
　お兄さんから買い取る持分は４分の１で所有権の価額は1,250万円となります。あなたは、お兄さんの所有権を買い取るための1,250万円が必要なことから、あなたの所有権の価額3,750万円のうち、3分の１（つまり、3/4×1/3＝全体の1/4　5,000万円×1/4＝1,250万円）を弟さんの会社へ売却し、その代金1,250万円をお兄さんに支払い、お兄さんの持分４分の１の所有権を取得すれば良いのです。
　ご質問のように法人に時価の2分の１以下の価額で売却すると、譲渡者である４人それぞれに対し、時価の5,000万円×１／４＝1,250万円を収入金額として譲渡所得として課税されます。また、法人に譲渡するにはお兄さんの承諾が必要ですし、全員に譲渡所得が課税されることになるため、お兄さんが承諾しないと考えられます。

わかりやすい解説ありがとうございました。
とても参考になりました。
この様な場合、具体的な解決策はないのでしょうか？

　解決策は事例により異なると思います。法務局や司法書士に相談すると良いと思います。