ギフト券の経費計上

税務は実質なので、ご質問者様の行為の実態は、クレジットカードのショッピング枠を利用した資金調達という整理になるのが通常ですので、

ギフトカードの購入価格が必要経費として認められない一方で、売却金額だけが課税所得を構成するという事実認定はされにくいと思われるものの、

そもそも論として、購入及び売却の証票書類は御座いますでしょうか。
まずは疎明資料を集めることが一番重要と思われます。

ご回答いただきありがとうございます。
購入した際の購入履歴や注文情報、売却時の記録についても、銀行振込なので現時点で確認できる範囲のものは保存しています。
まずはご指摘いただいた通り、取引の流れが分かる資料を整理・保管しながら、実態に沿った形で整理を進めていこうと思います。

税務調査が実際にある事、また売却を申告していなかった事がご心痛の種だと思いますが、通常は、収入（ギフト券売却）ー必要経費（ギフト券購入額）＝赤字　雑所得は発生しない　あえて事業所得に損失には計上しない

というご質問者様の過去の申告実績に違和感はないため、過度のご心配は不要とも思っています、調査が無事に終了する事を祈念しております。