代理店契約で報酬受け取り後に源泉徴収税を払えと言われました

源泉徴収されると所得税は、確定申告の際に計算した所得税から差し引かれます。

二月分の報酬はすべて受け取っています、その二月に頂いた報酬分の源泉徴収税を三月に入った今支払えと言われています、自分で申告すれば良いと思うのですが、源泉徴収税として支払いをしないといけないのでしょうか？

源泉徴収義務者は、所得税を徴収しないと、加算税等が科される場合があります。
それで、2月分について源泉徴収をしなかったので、源泉徴収税の請求をされていると考えます。