売上のほとんどが事業主貸について

問題ないです。事業主貸は、申告時点で事業主様の所得に計上されます。

スッキリしました。ご回答ありがとうございました。

　材料費や経費なども発生しますよね。それを現金で払おうが、ペイペイなどで払おうが、事業主借で経理してください。
　売上100（ペイペイに入金）、材料費30（ペイペイで支払い）
代表者貸100／売上100
材料費30／事業主借30
所得（青色控除前）：売上ー仕入（材料費）＝100ー30＝70（所得）
手持ち：事業主貸ー事業主借＝100ー30＝70（手持ち利益）
※売掛金や未収金、買掛金や未払金があるときは、手持ち利益は所得と一致しません。

振込むペイペイは
事業用のペイペイ口座なので
私用（食費など）で使った場合
事業用貸／ペイペイ口座

材料費は仕入高で入力してますが
仕入高／ペイペイ口座
freee
で入力してます。
あってますでしょうか?

お考えの仕訳でよろしいかと思います。会計科目でペイペイ口座の勘定があるのですね。区分経理されているので、より精度が高いと考えます。

安心しました。
何度もご回答いただきましてありがとうございました。
とても参考になりました。
お礼申し上げます。

あともう１つお聞きしたいのですが、プライベ用のペイペイとメルペイは配偶者のIDに生活費など
事業主貸として送って使うことがあります。

プライベート配偶者IDのペイペイとメルペイで材料や消耗品など購入した場合、

仕入高／事業主借で
処理していますが、
配偶者IDをプライベートに使用しても問題ないでしょうか?

ご回答いただけますと幸いです。

　配偶者IDは、事業用の口座ではないので、お考えのとおりです。
　銀行預金に置き換えて考えれば、分かりやすいと思います。

簿記はまったくわからないところで青色を始めてしまったのでわからないところが多くご丁寧に教えていただきありがとうございました。
感謝いたします。