booth手数料と振込手数料を経費にできますか？

　売上から差し引かれる手数料と、振込時に差し引かれている振込手数料は経費で良いと思います。
　一般的には、何も引かれる前の金額が売上ですから、結果振り込まれた金額との差額は必要経費で良いですね。
　証拠書類が無いとのことですが、相手から送られてくる売上明細と、結果振り込まれた金額の差額は当然手数料なので、差額で立証するしか無いですよね。手数料相当の資料が無いのであれば。。。通帳かネットバンクの取引明細で振込金額が分かるようにしておいてください

①手数料・振込手数料はいずれも経費計上が可能であり、原則として「総額売上、手数料経費」で処理するのが正攻法です。

BOOTHにおける販売では、購入者が支払った金額が本来の売上高となり、そこから差し引かれる販売手数料および振込手数料は「支払手数料」として経費計上します。実務上、入金額のみを収入とする処理も見られますが、売上規模が拡大した場合や説明責任の観点からは、売上と経費を分けて処理する方法がより適切と言えるでしょう。

②領収書については、必ずしも紙の領収書は必要ありません。BOOTHからダウンロード可能な売上明細や手数料CSVデータ、管理画面の取引履歴画面の保存が、帳簿付けの根拠資料として認められます。振込手数料についても、売上総額と実際の入金額との差額が継続的・合理的に説明できれば足りるとされるのが実務です。

重要なのは、金額の算定根拠が第三者から見て追える状態に整理されていることです。ここを丁寧に整えておけば、過度に構える必要はありません。