インボイス　売掛金の振込手数料負担する場合

インボイス後は①になります。
②の課税仕入れにしようとすると金融機関からインボイスを受け取らなければなりませんが、金融機関に振込手数料を支払ったのは買手であって売手は振込手数料相当額を値引きしたに過ぎません。
従って金融機関発行のインボイスを受け取ることができなければ②としても仕入税額控除の対象になりません。
どうしても課税仕入れにしたいのであれば、買手が金融機関から受取ったインボイスと買手が発行する立替金精算書を受け取らなければなりませんが、この場合、買手の課税仕入れになりません。
値引き処理なので、軽減税率対象であれば8％になります。
なお、令和5年度税制改正により税抜1万円未満の返還インボイスは発行免除となっています。

①が処理が簡易なんですね。
５月決算ですが、翌月入金確定後に売上が決定することになりますか？

簡単というより、先に記載しました通り②にすると貴社は仕入税額控除ができないことになります。
5月決算ですが・・・

→発生主義が原則なので入金確定後に売上が確定（現金主義）することになるというのが、よくわかりません。
現状、どのような処理をされているのか疑問です。

５月売上１０万　６月入金時に手数料６６０円
銀行入金９９，３４０　売掛金１０万
売上値引き６６０　処理になると思いますが、
５月の売上−６６０　となるのではなく
６月売上から−６６０ということですか？
財務に不慣れで説明うまくできず申し訳ありません。

5月（今期）の売上は10万円、6月（翌期）の売上値引きが660円です。
売上という収益確定時期は5月で、売上値引きという債務確定時期が6月ということです。

わかりやすく返答して頂きありがとうございました。