代表社員の妻に外注

ご質問についてです。

給与課税になる可能性が高いです。
外注費で計上したとしても、税務調査で否認されるリスクが高いので辞めておくことをおすすめします。
なので、社会保険等かかりますが、給料として支払う方がいいです

ご回答ありがとうございます。
給与課税になる可能性が高い理由は代表社員に妻なのだからでしょうか？それとも合同会社の社員（＝役員？）だからなのでしょうか？

両方ですね。
なので、奥様が合同会社の社員から外れたとしても、給与課税に取られる可能性があります。

奥様でなくても外注費と給与課税の問題はよく起こりますので気を付けた方がいいです。
消費税法基本通達1－1－1の内容で、給与課税となるか外注費となるか判断されるケースが多いです。