個人資産を会社が使用

①社長のローンは従前通り社長が個人の資金で返済するのであれば会社が立替えたということにはなりません。また、会社が社長個人の建物を使用するということであれば適正な賃料を支払うのが通常かと思います。
②社長所有の建物を担保にした融資が家賃に相当する訳ではありません。ご記載の内容だけで判断すれば、社長は担保提供者、融資の債務者が会社という取引に過ぎず、融資＝家賃にはなりません。会社は金融機関に融資の返済を行うのとは別に、社長の建物を使用するのであれば①の通り社長に賃料を払う形になると思います。
③②の通り、融資に関しては単に社長が担保提供者として建物を担保提供するだけだと思いますので、会社の資産にはなりません。したがって会社で減価償却費を計上することはできません。

社長所有の建物を担保に会社が融資を受けることと、当該建物を会社が使用（借りる）ことを混同されているように見受けられますが、金融機関への返済と社長への賃料を支払いは、それぞれ別の取引となります。

回答ありがとうごさいます。
私の説明が不足しておりました。
会社が融資600万を受けた中から、社長個人所有の建物のローン残を、金融機関に一括返済しました。
この場合は、会社に社長が借金したということになるでしょうか。

社長は会社から借入をしたか、借入でなければ役員報酬（法人税法上は会社の損金にはなりません）など経済的利益を享受したしたこととなります。
借入であれば最低限、会社への利息の支払いが必要となります。
役員報酬等の経済的利益の享受であれば所得税の課税対象となります。

わかりました。ありがとうございました。