税務署の受領印が貸借対照表と損益計算書にありませんでした

税務署は貸借対照表や損益計算書には受領印を押しません。
その内容で適正です。

税務署の収受印は、通常申告書だけに押されます。税法で決められているわけではないと思いますが、内部で統一はされていると思います。

回答します。

基本的には、それぞれの申告書の1枚目に受領印を押すというルールになっているので、税務署のされた対応は間違いではないです。

しかし、そこにしか押してはいけませんというルールではないので、税務署に個別にお願いをすると、貸借対照表や損益計算書などのページにも提出の押印をしてくださります。（私も差し替えた決算内訳書のページに提出印を押してもらったことがあります。）

銀行や取引先に決算書を提出するにあたり、きちんと税務署に提出したものだよという証拠が欲しいという話だと思います。税務署の職員が、機械的に付箋を確認せず押印しただけではないかと思うので、もう一度税務署に連絡し、押印してほしい旨を伝えると押してもらえると思います。電話する時、お伺いするときは「管理運営部門」というところに問い合わせるとよいかと思います。

頑張ってください。

ご回答下さったお三人様、ありがとうございました。
処理は適正とのことで納得いたしました。
前野税理士のアドバイスがありましたので、もう一度お願いしてみます。「確かに受領した」との確認が欲しいだけですので・・・。