個人用のお金の出入り

同一口座で取引をしているのであれば、残高を合わせるために仕訳をする必要があります。
事業に関係ない収入は
預金／店主借
事業に関係ない支出は
店主貸／預金
と仕訳を切って残高を合わせて下さい。

お答えいただきありがとうございます。
銀行口座内で事業用と個人用のお金を特別区分けしていないのですが、
とりあえず全部事業用として個人のお金の出入りは預金／店主借、店主貸／預金として処理しても問題ないでしょうか。

はい。
問題はありません。事業用と個人用でちゃんと説明がつけば大丈夫です。

分かりやすくお答えいただきありがとうございました。
疑問点が解決できてよかったです。