給与を0円にして、所得税を払っていない事に関して。

税理士の及川と申します。
よろしくお願いいたします。

「代表取締役社長」様ということになるかと思いますが、役員報酬を0円にしているからと言って、何も違法性はありません。

ただし、社長様個人の所得が0円ということになると、社長様個人で例えば住宅ローンを借りるなどの場合に融資が受けられない恐れが高くなります。

起業当初に受けたアドバイスだということなので、起業当初は赤字になることが多く、社長様の個人所得税を払ってまで赤字を増やすことはない、という趣旨でのアドバイスかと思います。
3年が経過し、事業が軌道に乗り黒字が出るようであれば、黒字の金額によっては、役員報酬を支払うことにより、節税になる可能性もあります。

検討された方が良いのではないでしょうか。