勤務医で給与所得を得ているが、他院で非常勤勤務で得た報酬を、事業所得として処理できるか

過去の判例や公表採決事例で、給与所得者が副業を事業所得で申告した事案が否認されています。
理由は、事業所得は社会通念上事業と言えることが要件で、社会通念上の事業とは、その業務に専ら従事し生計の主要な財源をそこから得ているものと解されます。
ご記載の前提では、非常勤勤務は専ら従事しているとは言えない為、事業所得は否認されると思いますので、顧問税理士が言っていることは正しいと思います。
最終的には税務署の判断になりますので、直接照会された方がよろしいかと思います。（個人的には、事業所得でＯＫという回答は得られないとは思いますが）

早速のご回答ありがとうございます。予防接種など臨時的な勤務のほかに定期的な勤務も想定しておりましたが、常勤先での勤務は週32時間（週4日）の縛りがありそれを満たす必要がありますので、他院での勤務はそれ以外の曜日もしくは時間帯、週にして2~3回、1日当たり8~10万円、月額ですと100万円をわすかに超える程度ですので、もっぱら従事しているとするには無理がありそうですね。ありがとうございました。