中古住宅を購入した場合の贈与税の確定申告および節税対策について

ご質問の状況（500万円がお義父様から奥様に貸し付けたお金である場合）ですと、奥様から相談者様に500万円が贈与されたことになりますので、相談者様に贈与税が課されることになります。
贈与額が500万円のときの贈与税は53万円になりますので、下記の特例を適用しない場合には3/15（今年は3/16）までに相談者様が贈与税の申告と納税を行う必要があります。
ただし、婚姻期間が20年を超えた夫婦間であれば2000万円の特別控除（贈与税の配偶者控除）がありますので、期限内に所定の書類を添付した贈与税の申告書を提出すれば贈与税はゼロとなります。
詳細につきましては下記サイトをご参照ください。
http://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/taxanswer/zoyo/4452.htm

上記の特例が適用できない場合には、500万円相当の持分（名義）を奥様に変更することで贈与税の課税を回避することができると考えます。
（出資額に応じた登記になっていれば贈与税の課税はありません。）

いずれの場合でも贈与税がからむケースになりますので、実行の際には事前に専門家にご相談されることをお勧めいたします。