退職金の二重支払、年度またいでしまった場合の処理

２回目の支払い分が返金して頂ける場合には、２回目の支払い分を「仮払金」等で会計処理し、損金経理をされなければ宜しいと考えます。

ご返答ありがとうございます。
もしも返金してもらえない場合は、当期で雑損失処理で良いのでしょうか？

ご連絡ありがとうございます。
返金して貰えない場合には退職者に対する贈与(寄付金)とみなされると思います。寄付金と認定された場合には損金算入できる金額に限度が生じますのでご留意ください。