飲食店を２法人に分けた場合の仕入れ経費の扱いについて

別法人なので按分ではなく、Aが支出するB分の仕入代金はAのBに対する立替金としてBに請求することが現実的かと思います。
租税回避行為と看做されないように、契約等で明確にすべきでしょう。

ご質問のようにAとBで２つの法人を設立した場合、Aで仕入れた材料をBに納品するためにはＡ法人でＢ法人に対する売上を計上し、Ｂ法人はＡ法人からの仕入を計上することになります。

Ａ法人名義で仕入れた材料をＢ法人に移動させたいと考えても、あくまでＡ法人で仕入れた材料はＡ法人の経費なので、立替金処理したとしても税務署からは利益操作と指摘される可能性が高いと思います。

ご質問の内容ですと１つの法人で２店舗経営されるほうが良いのではないかと思いますが、何かご事情がおありのことと思いますので参考になれば幸いです。

よろしくお願いいたします。

前田様、佐山様　迅速にご回答頂き誠にありがとうございます。
大変参考になりました。

ベストアンサーが決まったので以上としますが、適正な形で立替金の処理をすれば利益操作にはなりません。