役員報酬　定期同額給与

定期同額給与の変更は決算後3か月以内ですので、
上記の変更は認められず、9800円については税務上否認されます。

変更する時は決算3か月以内に届出をしてください。
今回、変更はいいけれど9800円の部分は経費に落ちない という事ですね。
この場合、役員賞与ですが事前確定届出給与を2月に提出致しました。
［職務執行期間開始の日の属する会計期間］の記入欄の1月～12月を全て300000円で提出したのですが問題ありますでしょうか？

問題はありません。
9800円部分だけを申告時に調整すれば大丈夫です。