従業員への退職後の対応について

未払い賃金の請求書が来てから、それと雇用契約書等を持って、税理士よりも弁護士のほうにご相談したほうが良いと思います。

①源泉徴収票については、とりあえず今出せるものを出すしかありませんね。というのも、その後未払い賃金の請求があってそれを払うのかどうか、払うとしてもどのような名目で払うのか（具体的には、過去の給料の不足分として払うのか、一時金として払うのか）によって税務上の処理が変わってくるのです。過去の年末調整やり直しもあり得ます。

②「未払い賃金が発生している」というのは、未払残業代のことでしょうか…もともといくら給料を払っていて、未払になっているのがいくらで、というのがわからないと、所得税が発生するほどの金額なのかまではわかりませんね。

お望みの回答ではないかもしれませんが、とりあえず回答できる範囲で回答してみました。参考になれば幸いです。