個人所有の車輛を下取りして法人名義の車輛を購入

会社に車両を売却したのではなく、役員個人の車両をディーラーなどの業者に売却（下取り）し、その代金の一部を法人の車両購入費に充てたので、経理処理は売却（下取り）金額が役員借入金です。
同族会社が役員個人から借入することはあり得ますので、特に問題はないと思います。

なるほど！！
役員借入金として処理すればよかったのですね。
個人と会社なので別の考え方をすべきなのかと思っていました。
という事は法人は役員借入金で処理したので、個人はディーラーで売却しているので、
計算上売却益が出たら今年の総合譲渡所得を申告する事になる。
という事ですよね。
ありがとうございます！！